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Projeto Debian anunciou a Biohackathon COVID-19 para ajudar no combate a pandemia

E o Projeto Debian anunciou a Biohackathon COVID-19 para ajudar no combate a pandemia. Confira os detalhes dessa iniciativa, e participe.

O movimento do Software Livre não se resume apenas a desenvolver software. Ele vai bem além disso, como mostra o pessoal do Projeto Debian.

Projeto Debian anunciou a Biohackathon COVID-19 para ajudar no combate a pandemia
Projeto Debian anunciou a Biohackathon COVID-19 para ajudar no combate a pandemia

Os desenvolvedores do Debian querem fazer sua parte para enfrentar a pandemia global de coronavírus, hospedando uma Biohackathon COVID-19. Este evento virtual organizado pelos desenvolvedores do Debian ocorrerá de 5 a 11 de abril.

Projeto Debian anunciou a Biohackathon COVID-19

A esperança deles com esta biohackathon é “melhorar o software livre biomédico e as ferramentas/bibliotecas que apoiam esses projetos”, ou seja, atuar onde o conhecimento dos membros do prjeto pode ser útil no combate à pandemia.

E entre o trabalho que eles esperam ver realizado neste hackathon, estão abordando vários bugs, contribuindo para o software de código aberto biomédico upstream e trabalhos relacionados.

Detalhes sobre a Biohackathon Debian COVID-19 podem ser encontrados em debian-devel-Announce.

Os envolvidos também já estão rastreando bugs marcados com COVID-19 para pacotes de software biomédicos e softwares que desejam adicionar nessa área.

Para aqueles que desejam ajudar de outras maneiras, o COVID-19 [email protected] permanece bastante ativo para auxiliar a pesquisa.
[email protected] quer seus ciclos de CPU para pesquisa com coronavírus

Confira abaixo uma cópia do anúncio:
Caro Comunidade Debian,

Haverá uma biohackathon COVID-19 virtual (online) de 5 a 11 de abril,
2020 e a equipe Debian Med convidam você para ajudar a melhorar o software livre biomédico
e as ferramentas / bibliotecas que suportam esses projetos.

A maioria das tarefas não requer nenhum conhecimento de biologia ou medicina, e todas
tipos de contribuições são bem-vindos: triagem de erros, testes, documentação,
Contribuições de IC, traduções, empacotamento e código.

1. Os bugs relacionados ao Debian podem ser visualizados em [covid19-bugs]

2. O software que aguarda empacotamento está listado em [covid-19-packages], por favor
responda à RFP com sua intenção, para não duplicarmos o trabalho

3. Você também pode contribuir diretamente para os pacotes upstream, vinculados
da página de tarefas Debian Med COVID-19 em [covid-19-packages]. Nota:
muitos pacotes de software biomédicos têm recursos limitados, mesmo
comparado a um projeto FOSS típico. Por favor, seja gentil com o rio acima
autor / mantenedor e perceber que eles podem ter recursos limitados para
revise sua contribuição. Triagem de problemas abertos e abertura de solicitações pull
corrigir problemas provavelmente será mais útil do que escolher sua codificação
estilo.

4. Arquiteturas / portabilidade: concentre-se no amd64, pois é o principal
arquitetura para software biomédico. Uma camada secundária seria arm64 /
ppc64el / s390x (mas cuidado com os problemas relacionados ao endian no s390x). A partir de um
perspectiva de hardware livre / aberto, seria ótimo ver mais riscv64
suporte, mas isso não é uma prioridade no momento

5. A equipe Debian Med também está tentando melhorar a disponibilidade de
pipelines / fluxos de trabalho biomédicos automatizados [fluxos de trabalho robustos] usando o
Padrão aberto do Common Workflow Language. A implementação de referência de
O CWL está escrito em Python e há muitos problemas abertos prontos para o trabalho
que não exigem nenhum conhecimento biomédico [cwltool-issues]

6. É muito fácil contribuir com a equipe Debian Med. Temos um baixo NMU
política para todos os nossos pacotes. As solicitações de mesclagem no Salsa geralmente são
processados ​​rapidamente (mas efetue o ping em alguns dos mais recentes Uploaders do
pacote para garantir que será notado). Ainda melhor se você pedir
associação à equipe e envie diretamente para o repositório de salsa.

7. A [debian-med-team-policy] deve responder a todas as perguntas sobre como
contribuir.

A principal biohackathon da COVID-19 está sendo organizada em [covid-19-bh20] e
para a participação do Debian, estamos usando [salsa-covid-19-bh20]

[covid-19-bugs] https://blends.debian.org/med/bugs/covid-19.html

[covid-19-packages] https://blends.debian.org/med/tasks/covid-19

[covid-19-bh20] https://github.com/virtual-biohackathons/covid-19-bh20

[salsa-covid-19-bh20]
https://salsa.debian.org/med-team/community/2020-covid19-hackathon

[fluxos de trabalho robustos] https://doi.org/10.1007/s41019-017-0050-4

[cwltool-issues] https://github.com/common-workflow-language/cwltool/issues

[Conselho COVID-19]
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for-public

[debian-med-team-policy] https://med-team.pages.debian.net/policy/

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Sobre o Edivaldo Brito

Edivaldo Brito é analista de sistemas, gestor de TI, blogueiro e também um grande fã de sistemas operacionais, banco de dados, software livre, redes, programação, dispositivos móveis e tudo mais que envolve tecnologia.

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