Projeto Debian anunciou a Biohackathon COVID-19 para ajudar no combate a pandemia

Haverá uma biohackathon COVID-19 virtual (online) de 5 a 11 de abril,
2020 e a equipe Debian Med convidam você para ajudar a melhorar o software livre biomédico
e as ferramentas / bibliotecas que suportam esses projetos.

A maioria das tarefas não requer nenhum conhecimento de biologia ou medicina, e todas
tipos de contribuições são bem-vindos: triagem de erros, testes, documentação,
Contribuições de IC, traduções, empacotamento e código.

1. Os bugs relacionados ao Debian podem ser visualizados em [covid19-bugs]

2. O software que aguarda empacotamento está listado em [covid-19-packages], por favor
responda à RFP com sua intenção, para não duplicarmos o trabalho

3. Você também pode contribuir diretamente para os pacotes upstream, vinculados
da página de tarefas Debian Med COVID-19 em [covid-19-packages]. Nota:
muitos pacotes de software biomédicos têm recursos limitados, mesmo
comparado a um projeto FOSS típico. Por favor, seja gentil com o rio acima
autor / mantenedor e perceber que eles podem ter recursos limitados para
revise sua contribuição. Triagem de problemas abertos e abertura de solicitações pull
corrigir problemas provavelmente será mais útil do que escolher sua codificação
estilo.

4. Arquiteturas / portabilidade: concentre-se no amd64, pois é o principal
arquitetura para software biomédico. Uma camada secundária seria arm64 /
ppc64el / s390x (mas cuidado com os problemas relacionados ao endian no s390x). A partir de um
perspectiva de hardware livre / aberto, seria ótimo ver mais riscv64
suporte, mas isso não é uma prioridade no momento

5. A equipe Debian Med também está tentando melhorar a disponibilidade de
pipelines / fluxos de trabalho biomédicos automatizados [fluxos de trabalho robustos] usando o
Padrão aberto do Common Workflow Language. A implementação de referência de
O CWL está escrito em Python e há muitos problemas abertos prontos para o trabalho
que não exigem nenhum conhecimento biomédico [cwltool-issues]

6. É muito fácil contribuir com a equipe Debian Med. Temos um baixo NMU
política para todos os nossos pacotes. As solicitações de mesclagem no Salsa geralmente são
processados ​​rapidamente (mas efetue o ping em alguns dos mais recentes Uploaders do
pacote para garantir que será notado). Ainda melhor se você pedir
associação à equipe e envie diretamente para o repositório de salsa.

7. A [debian-med-team-policy] deve responder a todas as perguntas sobre como
contribuir.

A principal biohackathon da COVID-19 está sendo organizada em [covid-19-bh20] e
para a participação do Debian, estamos usando [salsa-covid-19-bh20]

[covid-19-bugs] https://blends.debian.org/med/bugs/covid-19.html

[covid-19-packages] https://blends.debian.org/med/tasks/covid-19

[covid-19-bh20] https://github.com/virtual-biohackathons/covid-19-bh20

[salsa-covid-19-bh20]
https://salsa.debian.org/med-team/community/2020-covid19-hackathon

[fluxos de trabalho robustos] https://doi.org/10.1007/s41019-017-0050-4

[cwltool-issues] https://github.com/common-workflow-language/cwltool/issues

[Conselho COVID-19]
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for-public